name: topol_vary description: 改变某些原子之间的结构参数,进行拉伸、弯曲、旋转等操作 license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms
Overview
调用craton包,改变某些原子之间的结构参数,进行拉伸、弯曲、旋转等操作
Arguments
| 参数名 | 类型 | 必填 | 描述 |
|---|---|---|---|
inputs |
string | 是 | 分子文件,可以是smiles, csv文件,或mol\sdf\pdb等格式的分子文件,或包含这些文件的路径 |
atoms |
string | 是 | 原子组合,输入形式如1-2,4-5-6,7-8-9-10 |
value |
float | 是 | 改变的数值 |
del_value |
boolean | 是 | 是否在现有参数上进行增减 |
output_path |
string | 否 | 文件输出的目录,默认输出在当前文件下 |
Quick Start
##如果有输出文件夹
craton stru vary -i {{inputs}} -a {{atoms}} -v {{value}} -o {{output_path}}
##如果没有输出文件夹
craton stru vary -i {{inputs}} -a {{atoms}} -v {{value}}