name: prepare_protein description: 对蛋白pdb文件,进行预处理,对N、C端进行封端,对特定残基进行离子化,弥补缺失的原子等。得到准备好的pdb文件 license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms
Overview
对蛋白pdb文件,进行预处理,对N、C端进行封端,对特定残基进行离子化,弥补缺失的原子等。得到准备好的pdb文件
Arguments
| 参数名 | 类型 | 必填 | 描述 |
|---|---|---|---|
input_file |
string | 否 | 输入的pdb文件 |
output_file |
string | 否 | 预处理后,输出的pdb文件 |
output_path |
string | 否 | 文件输出的目录,默认输出在当前文件下 |
Quick Start
##如果有输出文件名,和输出的文件夹
craton prepare protein -i {{input_file}} -of {{output_file}} -o {{output_path}}
##有输出文件名,没有输出的文件夹
craton prepare protein -i {{input_file}} -of {{output_file}}
##缺失输出文件名和输出的文件夹
craton prepare protein -i {{input_file}}