name: prepare_mutation description: 将蛋白中某个氨基酸(残基)突变成另一种氨基酸 license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms
Overview
将蛋白中某个氨基酸(残基)突变成另一种氨基酸
Arguments
| 参数名 | 类型 | 必填 | 描述 |
|---|---|---|---|
protein_file |
string | 是 | 输入的pdb文件 |
residue |
string | 是 | 被突变的残基(氨基酸),格式:127-ARG-H |
mutation |
string | 是 | 突变后的氨酸名称,如LEU |
output_file |
string | 否 | 突变后,输出的pdb文件的名称 |
output_dir |
string | 否 | 文件输出的目录,默认输出在当前文件下 |
Quick Start
##如果有输出文件名,和输出的文件夹
craton prepare mutation -i {{input_file}} -r {{residue}} -m {{mutation}} -of {{output_file}} -o {{output_path}}
##有输出文件名,没有输出的文件夹
craton prepare mutation -i {{input_file}} -r {{residue}} -m {{mutation}} -of {{output_file}}
##缺失输出文件名和输出的文件夹
craton prepare mutation -i {{input_file}} -r {{residue}} -m {{mutation}}