name: mm_scan description: 利用力场,对分子的所有可旋转键(torsion)进行势能面扫描,得到torsion的势能面曲线 license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms
Overview
调用craton包,基于分子力场,对分子的所有可旋转键进行势能面扫描,可旋转键一般是非环内的单键,最终得到势能面曲线。势能面曲线对分析分子的构效关系非常重要
Arguments
| 参数名 | 类型 | 必填 | 描述 |
|---|---|---|---|
inputs |
string | 是 | 分子文件,可以是smiles, csv文件,或mol\sdf\pdb等格式的分子文件,或包含这些文件的路径 |
output_path |
string | 否 | 文件输出的目录,默认输出在当前文件下 |
Quick Start
##如果有输出文件夹
craton mm scan -i {{inputs}} -o {{output_path}}
##如果没有输出文件夹
craton mm scan -i {{inputs}}