name: mm_frequency description: 利用力场计算分子的振动频率 license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms
Overview
调用craton包,基于分子力场,计算分子的振动频率,振动频率是hessian矩阵的迹,共3N(N是原子的数目)个值,其中6个数值接近零,代表三个平动、三个转动,剩下3N-6个振动频率
Arguments
| 参数名 | 类型 | 必填 | 描述 |
|---|---|---|---|
inputs |
string | 是 | 分子文件,可以是smiles, csv文件,或mol\sdf\pdb等格式的分子文件,或包含这些文件的路径 |
output_path |
string | 否 | 文件输出的目录,默认输出在当前文件下 |
Quick Start
##如果有输出文件夹
craton mm calculate freq -i {{inputs}} -o {{output_path}}
##如果没有输出文件夹
craton mm calculate freq -i {{inputs}}