name: ff_atom_type description: 为分子的每个原子分配合适的原子类型。确认原子类型,后续才能获取相应的力场参数 license: Proprietary. LICENSE.txt has complete terms
Overview
为分子的每个原子分配合适的原子类型。确认原子类型,后续才能获取相应的力场参数
Arguments
| 参数名 | 类型 | 必填 | 描述 |
|---|---|---|---|
input_file |
string | 是 | 输入的分子文件或smiles |
atom_type_file |
string | 否 | 原子类型定义文件 |
output_path |
string | 否 | 文件输出的目录,默认输出在当前文件下 |
Quick Start
如果不指定原子类型定义文件
craton ff atom_type -i {{input_file}} -o {{output_path}}
##没有输出的文件夹
craton ff atom_type -i {{input_file}}
##如果指定了原子类型定义文件
craton ff atom_type -i {{input_file}} -f {{atom_type_file}} -o {{output_path}}